上海市2007-2013年HIV-1分子流行病学演变趋势.docVIP

上海市2007-2013年HIV-1分子流行病学演变趋势 吴健1 王绪琴2 周艳秋3 郁晓磊2 盖晶2袁家麟1 郑敏4 陶静5 薛以乐2 康来仪2 （ 上海市黄浦区疾病预防控制中心上海200041； 上海市疾病预防控制中心，上海 200023，. 上海市静安区疾病预防控制中心，上海 200336；.上海市长宁区疾病预防控制中心，上海 200051；5.上海市虹口区疾病预防控制中心，上海 200082） 2007-2013年HIV-1亚型流行趋势。方法 随机选取2007-2013年确认的随访HIV-l感染者血浆标本1296例，应用反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增，DNA测序，系统进化树分析，并结合流行病学资料进行分析。结果 获得1085例pol区基因片段，其中亚型分布显示，CRF01_AE所占比例最大，为59.1％(641/1085)，其次为CRF07_BC为23.1％(251/1085)、B亚型为9.3％(101/1085)、CRF08_BC为4.2％(46/1085)、C亚型为1.1％(12/1085)、CRF55_01B为0.9％（10/1085）、CRF59_01B为0.8％（9/1085）、CRF02_AG为0.6％(6/1085)、CRF58_01B为0.3％（3/1085）、未定型CRF_01B为0.3％(3/1085)、CRF67_01B为0.2％(2/1085)和G亚型为0.2％(2/1085)。其中 CRF01_AE从2007年64.3%到2013年的53.2%，呈现逐年下降趋势，而CRF07_BC从2007年的8.6%上升到2013年的29.1%。CRF01_AE、CRF07_BC和B亚型均以性传播途径为主，其中同性传播分别为61.3%（393/641）、49.8%（125/251）、51.5%（52/101）和异性性传播分别为36.3%（233/641）、35.5%（89/251）、44.6%（45/101）；CRF08_BC以异性传播为主，占60.9%（28/46）； C亚型、CRF55_01B、 CRF59_01B和CRF58_01B均以性传播为主；CRF02_AG以异性传播为主，未定型CRF01_B、CRF67_01B和G亚型均以同性传播为主。结论 上海市2007-2013年HIV-1亚型变化明显，目前以CRF01_AE和CRF07_BC为主。继续加强对HIV-1基因亚型监测具有重要意义。 关键词：人免疫缺陷病毒-1型；亚型/重组体 Study on the Molecular Epidemiological Characteristics of Human Immunodeficiency Virus Type 1 in Shanghai，2007-2013 WU Jian1，WANG Xu-qin，ZHOU Yan-qiuYU Xiao-lei2，GAI Jin，ZHENG Min4， TAO Jing, Xue Yi-lei2，Kang Lai-yi. 1.Center for Disease Control and Prevention, huangpu District，Shanghai 20002, China；2. Shanghai Municipal Center for Disease Control and Prevention，Shanghai 200336，China；3. Center for Disease Control and Prevention, District，Shanghai 20001, China；4.Center for Disease Control and Prevention, changning District，Shanghai 200051, China； Center for Disease Control and Prevention, hongkou District，Shanghai 200082, hina； AbstractObjective To better understand the HIV-1 phylogenetical tendency from 2007 to 2013 in Shanghai. Methods A total of 1296 people with HIV-1-infection, who lived in Shanghai, were randomly sampled and their plasma was collected. The samples were amplified by nest RT-PCR, DNA was sequence