利用SSR标记进行家蚕部分品种资源的指纹图谱分析..docVIP

利用SSR标记进行家蚕部分品种资源的指纹图谱分析 侯成香1，李木旺1，张月华1，钱荷英1，孙平江1，徐安英1，苗雪霞2，郭秋红2，相 辉2，黄勇平2 (1中国农业科学院蚕业研究所，镇江 212018；2中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所，上海 200032 摘要：【目的】通过构建家蚕品种资源的亲缘关系。：家蚕；品种资源；标记；指纹图谱 Analysis of SSR Fingerprints in Part of the Silkworm Germplasm Resources HOU Cheng-xiang1, LI Mu-wang1, ZHANG Yue-hua1, QIAN He-ying1, SUN Ping-jiang1, XU An-ying1, MIAO Xue-xia2, GUO Qiu-hong2, XIANG Hui2, HUANG Yong-ping2 ( 1Sericultural Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Zhenjiang 212018; 2Institute of Plant Physiology and Ecology, Shanghai Institutes for Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences, Shanghai 200032 ) Abstract: 【Objective】The genetic relationships among silkworm strains were analyzed by constructing their fingerprints. 【Method】35 SSR markers were used to construct 96 silkworm races. All of the SSR markers were polymorphic and unambiguously separated silkworm strains from each other. 【Result】 A total of 467 alleles were detected with a mean value of 12.77 alleles/locus (range 328). The mean polymorphism index content (PIC) was 0.71 (range 0.299﹣0.919). UPGMA cluster analysis of Nei’s genetic distance grouped silkworm strains based on their origin. 【Conclusion】 The results indicated that SSR markers are an efficient tool for fingerprinting cultivars and conducting genetic-diversity studies in the silkworm. Key words: Silkworm (Bombyx mori L.); Germplasm; SSR marker; Fingerprint 0 引言 【本研究的重要意义】家蚕是重要的经济昆虫。长期以来，丝绸一直受到国际市场的欢迎，蚕丝业在中国、印度及其它的发展中国家扮演着重要的角色。家蚕品种资源是家蚕育种的基础[1]，中国、日本、印度等国家共保存了数千份蚕种质资源（其中部分品种为重复保存）。中国是蚕丝业的发源地，有着丰富的蚕种质资源，中国农业科学院蚕业研究所保存了660个来自不同区域的不同化性、眠性的蚕品种，其中包括了来自中亚、欧洲、日本等国家和地区的蚕种质资源，并调查了家蚕品种资源的常规性状和特殊性状[2, 3]。部分品种资源在形态学上差异较大，但很多品种仅从形态学上是很难区分的。【前人研究进展】随着分子生物学的发展，很多类型的分子标记得到了运用，这些分子标记已经在很多物种（包括蚕）中被用来研究分子 连锁图构建、遗传多样性分析、品种鉴定、分子标记辅助育种等。简单重复序列（simple-sequence repeats, SSR），也称微卫星，在真核生物中是随机广泛分布的，并且作为分子标记应用越来越多。微卫星由于其高度的多态性，作为一个标记系统在基因组分析中有很高的潜在应用价值[4]，并被广泛用于遗传多样性分析[5~8]和分子遗传图谱构建[9~11]。近年来，微卫星标记在家蚕中也得到了分离和应用。Reddy[12]分离出28个微卫星位点，用其中的15个微卫