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* * * * * * * * * * * * 遗传数据基因定位的统计方法简介 * 小结 基本概念 Hardy-Weinberg平衡 连锁分析:Lods连锁分析 关联分析:群体关联分析 基因型关联分析和等位基因关联分析 连锁与连锁不平衡 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. * 遗传数据基因定位的统计方法简介 * ……THE END THANK YOU! Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 对于遗传模式的确定,可以通过家系调查,对基因的分离行为进行遗传学分析,即分离分析(segregation analysis),对上一代的基因传到下一代的分离比率进行估计或检验,来确定某性状或遗传病的遗传模式。 * * 奇数次交叉?重组配子 偶数次交叉?非重组配子 * * * * * * 遗传数据基因定位的统计方法简介 * 由于连锁导致的共分离现象只有在家系内部才能观察到,所以,检测连锁必须要有家系调查资料。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. * 遗传数据基因定位的统计方法简介 * 2.1 Lods 连锁分析 Lods连锁分析法:log odds score法,即对数优势记分法 这是基于遗传模式(model-based)的连锁分析方法,应已知 要研究性状的遗传模式; 性状控制位点的等位基因数目; 每种基因型的外显率。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. * 遗传数据基因定位的统计方法简介 * Lods是指两个位点按某一重组率 连锁时,产生所观察到的家庭的概率与不存在连锁情况下 产生该家庭的概率之比的对数,即 计算不同 下的Z值,对应最大Z值的 即为所求的重组率。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. * 遗传数据基因定位的统计方法简介 * 一般地,当 Z 3 时,可以认为存在连锁,相当于P0.001,表示连锁发生的可能性为不发生的1000倍。 连锁重组率 值的意义为: 紧密连锁 松弛连锁 中度连锁 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. * 遗传数据基因定位的统计方法简介 * 例题: 假定控制某种疾病的位点位于常染色体上,遗传模式为显性,疾病位点上有两个等位基因D和d,引起疾病的等位基因D在人群中很少。同时假定一个标记位点有两个等位基因M和m。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. * 遗传数据基因定位的统计方法简介 * 例:研究者通过调查得到一个家庭的数据(如下图所示)。此家庭数据包含三方面的信息。 家庭成员的患病状态 每一成员的标记基因型 成员之间的亲缘关系。 家庭成员的疾病位点的基因型是不能通过实验手段得到的,因为未知疾病位点的位置。 问题:疾病位点是否与标记位点连锁? Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 祖父 祖母 父亲 母亲 女儿
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