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第一章 基因的结构 第一节 基因和基因组 一、基因(gene)? 是合成一种功能蛋白或RNA分子所必须的全部DNA序列. 一个典型的真核基因包括: ? ①编码序列—外显子(exon) ? ②插入外显子之间的非编码序列—内合子(intron) ? ③5-端和3-端非翻译区(UTR) ? ④调控序列(可位于上述三种序列中) 绝大多数真核基因是断裂基因(split-gene),外显子不连续。 ? 二、基因组(genome) 一特定生物体的整套(单倍体)遗传物质的总和,基因组的大小用全部DNA的碱基对总数表示。 人基因组3X109(30亿bp),共编码约10万个基因。 每种真核生物的单倍体基因组中的全部DNA量称为C值,与进化的复杂性并不一致(C-value Paradox)。 ? 人类基因组计划(human genome project, HGP) 基因组学(genomics),结构基因组学(structural genomics)和功能基因组学(functional genomics)。蛋白质组(proteome)和蛋白质组学(proteomics) 第二节 真核生物基因组 一、真核生物基因组的特点: ①真核基因组DNA在细胞核内处于以核小体为基本单位的染色体结构中. ②真核基因组中,编码序列只占整个基因组的很小部分(2—3%), 二、真核基因组中DNA序列的分类 #8226; ? (一)高度重复序列(重复次数lO5) 卫星DNA(Satellite DNA) ? (二)中度重复序列 ? 1.中度重复序列的特点 ? ①重复单位序列相似,但不完全一样, ? ②散在分布于基因组中. ? ③序列的长度和拷贝数非常不均一, ? ④中度重复序列一般具有种属特异性,可作为DNA标记. ? ⑤中度重复序列可能是转座元件(返座子), ? 2.中度重复序列的分类 ? ①长散在重复序列(long interspersed repeated segments.) LINES ? ②短散在重复序列(Short interspersed repeated segments) SINES ? SINES:长度500bp,拷贝数105.如人Alu序列 ? LINEs:长度1000bp(可达7Kb),拷贝数104-105,如人LINEl ? (三)单拷贝序列(Unique Sequence) ? 包括大多数编码蛋白质的结构基因和基因间间隔序列, ? 三、基因家族(gene family) ? 一组功能相似且核苷酸序列具有同源性的基因.可能由某一共同 ? 祖先基因(ancestral gene)经重复(duplication)和突变产生。 ? 基因家族的特点: ? ①基因家族的成员可以串联排列在一起,形成基因簇(gene cluster)或串联重复基因(tandemly repeated ? genes),如rRNA、tRNA和组蛋白的基因; ? ②有些基因家族的成员也可位于不同的染色体上,如珠蛋白基因; ? ③有些成员不产生有功能的基因产物,这种基因称为假基因 (Pseudogene). ? Ψa1表示与a1相似的假基因. ? 假基因分类。加工过的假基因(processed pseudogene)。 ? 典型的基因家族 ? 1.tRNA基因 ? 单倍体人基因组中1300个tRNA基因,tRNA基因簇. ? 2.rRNA基因 ? l00copy.rRNA基因簇(重复单元28S、18S、5.8s-rRNA) ? 3.组蛋白基因 ? 30-40copy.定位:7q32-q36 ? 组蛋白基因簇(重复单位:H1,H2A,H2B,H3、H4) ? 特点:无intron,Poly(A)- RNA. ? 4.珠蛋白基因 ? α类:16p13,基因簇(24Kb):5’—ζ—Ψζ—Ψα1—α2—α1—3’ ? β类:11p15,基因簇(60Kb):5’— ζ—Gr—Ar—Ψβ—δ—β—3’ ? 四、超基因家族(Supergene family ,Superfamily)
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