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限制酶

ApaI (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5GGGCC^C 3 BamHI(类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 G^GATCC 3 BglII (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 A^GATCT 3 EcoRI (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 G^AATTC 3 HindIII (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 A^AGCTT 3 KpnI (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 GGTAC^C 3 NcoI (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 C^CATGG 3 NdeI (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 CA^TATG 3 NheI (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 G^CTAGC 3 NotI (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 GC^GGCCGC 3 SacI (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 GAGCT^C 3 SalI (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 G^TCGAC 3 SphI (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 GCATG^C 3 XbaI (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 T^CTAGA 3 XhoI (类型:Type II restriction enzyme ) 识别序列: 5 C^TCGAG 3 * * 质粒DNA的酶切鉴定 及琼脂糖凝胶电泳 1. 实验目的和要求 学习和掌握限制性内切酶的特性、酶解和琼脂糖凝胶电泳的操作方法,并理解限制性内切酶是DNA重组技术的关键工具,琼脂糖凝胶电泳是分离鉴定DNA片段的有效方法。 2. 相关基础知识 限制性核酸内切酶:是一类能识别双链DNA分子特异性核酸序列的DNA水解酶。是体外剪切基因片段的重要工具,所以常常与核酸聚合酶、连接酶以及末端修饰酶等一起称为工具酶。限制性核酸内切酶不仅是DNA重组中重要的工具,而且还可以用于基因组酶切图谱的鉴定。 1) 寄主控制的限制与修饰现象 2) 核酸限制性内切酶的类型 3) 核酸限制性内切酶的基本特性 4) 同裂酶和同尾酶 5) 核酸限制性内切酶的命名法 6) 影响核酸限制性内切酶活性的因素 1) 寄主控制的限制与修饰现象 限制与修饰系统是细胞的一种防卫手段。 各种细菌都能合成一种或几种能够切割DNA双链的核酸内切酶,它们以此来限制外源DNA存在于自身细胞内,但合成这种酶的细胞自身的DNA不受影响,因为这种细胞还合成了一种修饰酶,对自身的DNA进行了修饰,限制性酶对修饰过的DNA不能起作用。这种现象被称为寄主控制的限制与修饰现象。 2)限制性核酸内切酶的类型及特性 按限制酶的组成、与修饰酶活性关系以及切断核酸的情况不同,分为三类: Ⅰ型 Ⅱ型* Ⅲ型 第一类(I型)限制性内切酶能识别专一的核苷酸顺序,并在识别点附近的一些核苷酸上切割DNA分子中的双链,但是切割的核苷酸顺序没有专一性,是随机的。这类限制性内切酶在DNA重组技术或基因工程中用处不大,无法用于分析DNA结构或克隆基因。这类酶如EcoB、EcoK等。 第二类(II型)限制性内切酶能识别专一的核苷酸顺序,并在该顺序内的固定位置上切割双链。由于这类限制性内切酶的识别和切割的核苷酸都是专一的。因此,这种限制性内切酶是DNA重组技术中最常用的工具酶之一。这种酶识别的专一核苷酸顺序最常见的是4个或6个核苷酸,少数也有识别5个核苷酸以及7个、8个、9个、10个和11个核苷酸的。 II 型限制性内切酶的识别顺序是一个回文对称顺序,即有一个中心对称轴,从这个轴朝二个方向“读”都完全相同。这种酶的切割可以有两种方式: 粘性末端;是交错切割,结果形成两条单链末端,这种末端的核苷酸顺序是互补的,可形成氢键,所以称为粘性末端。 如EcoRI的识别顺序为: 5’…… G’AA|TT_C ……3’ 3’…… C_TT|AA’G …… 5’ 垂直线表示中心对称轴,从两侧“读”核苷酸顺序都是GAATTC或CTTAAG,这就是回文顺序(palindrome)。_和‘表示在

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