蛋白质翻译精选.ppt

5.1. 基本概念 5.2. 基本元件 5.3. Genetic Code 5.4. peptide synthesize 5.5. 保证peptide准确翻译的机制 5.1.基 本 概 念 ● the second step of gene expression ● tRNA as a adapter (转接器) for codon amino acid ● tRNA loading aa by aa-tRNAaa 合成酶 (氨酰tRNA合成酶，AARS) ● tRNA recognition codon by anti-codon（反密码子） ● codon： universal triplex codon 三联体密码子 two of three reading codon 三中读二 codon in codon 广义密码子 ● codon degeneracy：wobble hypothesis 摇摆假说 isoacceptor 同工受体 ● codon usage (codon bias) 密码子的利用（偏爱） 5.1.1. tRNA ● mini RNA, 4S, (74-94 Nt) ● tRNA phe, 77Nt cloverleaf form (1964 Holly R.) ● 4 arms 4 loops ● Nt more modified by methylation ---aa 接受臂 ; loading aa at 3’ end ---DHU loop; contact with AARS ---anti-codon loop; ---TΨC loop; contact with 5s rRNA ---extra loop; 分类标准 tRNACys表示转运半胱氨酸的tRNA Cys-tRNACys表示携带了半胱氨酸的tRNACys ● tRNA的”L”三维结构与功能 “L”构型的结构力 ---二级结构中双链区的碱基堆积力和氢键 ---二级结构中非双链区在“L”结构中，形成氢键结合 ---“L”结构中碱基堆积力大 使其拓扑结构趋于稳定 --- wobble base （摇摆碱基） 位于“L”结构末端 堆积力小 自由度大 使碱基配对摇摆 --- TΨC loop DHU loop 位于“L”两臂的交界处， 利于“L”结构的稳定 “L”结构域的功能 ---anti-codon loop 位于”L”另一端，与结合在核糖体 小亚基上的codon of mRNA配对 aa’-tRNAaa have GC content of 60% Rich methylation each cell contains from several hundred to over 20,000 copies of rDNA gene rRNA synthesized in nucleolus Ribosomal genes (rDNA) are different in several ways from other nuclear gene 5.2.2. rRNA ● Prokaryote 23S, 16S, 5S / Eukaryote 28S-5.8S, 18S, 5S ● Rich methylation (m2U, m3A, m3U, m26A(二甲基)…) 细菌核糖体70S 真核生物核糖体80S ● In Prok. ● 5s rRNA 与TΨC loop of tRNA部分同源，并可配对 In Euk. AMEAMECCUGCGGUUGGAUGACCUCCUU AMEAMECCUGCGGAAGGAUGAUUA ● 23s rRNA --- 6 domains ---有的与对抗生素的抗性有关 ---2660±Nt region α-I loop (alpha Sarcin) binding with complex of aa-tRNAaa~(EF)-Tu~GTP (引起核糖体变构！！) G2661 ? C , aa-tRNAaa into A site go down ---G2252, G2253双突变为C, 将对转肽酶的活性产生抑制 mRNA具有两个必需的特征： 可翻译的密码序列（开放阅读