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第三章 蛋白质研究技术 第一节 蛋白质的分离纯化 第二节 蛋白质的鉴定 第三节 蛋白质的检测 第四节 蛋白质的结构分析 第一节 蛋白质的分离与纯化 一、蛋白质分离纯化的基本原则 二、蛋白质分离纯化的方法 一、蛋白质分离纯化的基本原则 1、选择丰度高、便于提取的材料 (磷酸单脂酶,肝、胰、脾丰富,但选几乎不含磷酸二脂酶的前列腺) 2、了解目的蛋白质的稳定性 (肝素材料的冷冻和干燥) 3、探索有效的抽提和浓缩方法 (包括细胞破碎,抽提系统,浓缩:沉淀、吸附、超滤、透析、冻干等) 4、建立一套层析组合方法和检测方法 (如吸附、离子交换、亲和层析、凝胶过滤;纯化评价) 5、包装、贮存方法(生产日期、批次、含量或效价) 二、蛋白质分离纯化的方法 粗提: 1.盐析: 固体加入法: 饱和溶液加入法: 2.有机溶剂沉淀: 3.结晶(10-50mg/ml) 4.等电点沉淀 精提 :1.离心(centrifugation) 2.电泳(electrophoresis) 3.层析(chromatography) 1.离心(centrifugation) 原理:悬液中的各种粒子(细胞,细胞器及大分子)有不同质量(mass)或密度(density),故在离心场中有不同沉降速率。 ? 蛋白质分子量差别很大,密度差别很小(不超过15% )。蛋白质的平均密度是 1.37 g/cm3。结合蛋白密度差异较大。 ?沉降系数(sedimentation constant):颗粒在单位离心力场中粒子移动的速度(S)。 离心(centrifugation) ①.差速离心(differential centrifugation) ②.速率区带离心(rate-zonal centrifugation) ①.差速离心(differential centrifugation) 利用不同物质沉降速率的差异,通过离心速度差异分离不同质量颗粒的离心技术。 ?从组织匀浆中将可溶性的蛋白质与不溶性成分分开。 ?离心后,蛋白质留在上清液(Supernatant)中,其他成分形成沉淀(Pellet) 细胞成份的差速离心分离 ②.速率区带离心(rate-zonal centrifugation) 也称平衡密度梯度离心,根据颗粒在介质中的沉降速度差异分离目标颗粒的方法。 ?蔗糖、甘油或氯化铯形成密度梯度; ?超速离心机(≈40,000 r/min) ?离心后,分离物分布在相应的密度区带内; 注意: ?控制时间:太短,不能充分分离;太长,分离物沉淀到离心管底部。 ?不能精确测定分子量,因为蛋白质的 形状差异影响沉降率; ?一次分离多种不同类型聚合物或颗粒 的最有效方法 多用于分离细胞器,DNA 2. 电泳(electrophoresis) 带电颗粒在电场中的移动速度的差异,从而将其分离。由电荷 –质量比决定。 按支持物:移动界面电泳,聚焦电泳,区带电泳(凝胶、线丝)等 按电泳装置:水平平板,垂直平板,圆盘,双向电泳,毛细管电泳, 脉冲电泳。 常用的电泳方法 ①SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS) ②等电聚焦(isoelectric focusing ,IEF ) ③双向电泳(two-dimensional gel electrophoresis) ④脉冲电泳(pulsed-field gel electrophoresis) ①.SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-polyacrylamide gel electrophoresis,PAGE) 凝胶 ?丙烯酰胺(acrylamide),甲叉双丙烯酰胺(methylene bisacrylamide)聚合而成;T%= (a:单体g;b:双体g; m:溶液体积) ?凝胶孔径:选择丙烯酰胺浓度,甲叉双丙烯酰胺胶联剂的浓度;C%= (a:b=19:1) ?凝胶有分子筛效应。 SDS SDS(sodium dodecyl sulfate) ?阴离子洗涤剂,几乎能破坏天然蛋白质中所有的非共价键,使亚基解聚(巯基乙醇),使多肽链呈伸展状态,消除了蛋白质构形对迁移率(migration rate)的影响; ? SDS以1:2 的比例与肽链中的氨基酸残基结合,使变性蛋白质带上大量的净负电荷,而且电荷量与蛋白质分子量(即肽链长度)成正比。所以分子量成为决定蛋白质迁移率的唯一因素。 SDS ? SDS分离的蛋白质
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