Chapter真核基因组的包装说课.ppt

二、染色质修饰沉默基因组 1. 组蛋白去乙酰化 哺乳动物: HDAC1, HDAC2 酵母 : Rpd3 组蛋白去乙酰化酶 (HDACs) DNA甲基转移酶: Dnmt1, Dnmt3a , Dnmt3b 2. DNA 甲基化 C→ 5-mC 低等真核生物: 稀有 脊椎动物 :10%, 5′–CG–3′ 植物: 30%, 5′–CNG–3′ （1）维持甲基化 （2）重新甲基化 在新的位置上进行甲基化 DNA复制以后，在新链上对应于母链的甲基化位置上进行甲基化 Dnmt1, Dnmt3a , Dnmt3b （3）人CpG 岛的甲基化 CpG 岛不甲基化 某种组织里正在表达的特异基因的 CpG 岛不甲基化 ① 管家基因（Housekeeping genes）: ②组织特异性基因 （4）基因组印记与DNA甲基化 基因组印记（Genomic imprinting）: 同源染色体上的一对等位基因中只有一个表达，另一个被甲基化所沉默 人类和小鼠至少有30个基因表现印记 有的基因来自于父本，有的来自于母本 人11号染色体上的一对印记基因 （5）X染色体失活与DNA甲基化 组蛋白 H2A 被特殊组蛋白 macroH2A1所代替. 是一种特殊的印记，导致雌性哺乳动物的两条X染色体中的一条几乎整条被印记. Xist基因: 转录出长达25-kb的非编码RNA 组蛋白H4去乙酰化 部分DNA序列高度甲基化. 机理: X染色体失活： * Title: General Model of the Association of Histones Caption: General model of the association of histones and DNA in the nucleosome, showing how the chromatin fiber can coil into a more condensed structure, ultimately producing a metaphase chromosome. * Title: General Model of the Association of Histones Caption: General model of the association of histones and DNA in the nucleosome, showing how the chromatin fiber can coil into a more condensed structure, ultimately producing a metaphase chromosome. * Matrix-associated regions (MARs) scaffold attachment regions (SARs) * hydroxyl group(羟基） serine（丝氨酸） histidine（组氨酸） /wiki/CpG_site#CpG_islands Cytosines in CpG dinucleotides can be methylated to form 5-methylcytosine. In mammals, methylating the cytosine within a gene can turn the gene off, a mechanism that is part of a larger field of science studying gene regulation that is called epigenetics. Enzymes that add a methyl group are called DNA methyltransferases. In mammals, 70% to 80% of CpG cytosines are methylated.[1] * 第二章 真核基因组的包装 第一节 真核生物染色体 一、化学组成： ① DNA 线形 ② 蛋白质 Histones（组蛋白）： H1，H2A，H2B，H3，H4 Nonhistones（非组蛋白）： 1. 染色质的基本结构————核小体模型 8 组蛋白分子（H2A+H2B+H3+H4）×2 核心： 147bp DNA: 环绕核心. 二、空间结构 （1）核小体的组成 DNA 螺旋 组蛋白: 四种颜色 “串珠” 两个核小体之间 53bp spacer DNA 和 H1结合 2. 染色质的高级结构 （1） DNA 核小体 2nm 2nm 11nm 直径： （2） 核小体 11nm 30nm