山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷与人血清白蛋白 相互作用的研究.docVIP

山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷与人血清白蛋白 相互作用的研究.doc

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毕业论文(设计) 山酚-7-O-α-L-鼠李糖苷与相互作用的研究::P:化 工 学 院 :制 药 工 程 :级制药工程班 : 2015年 月 日摘 要 3 关键词 3 ABSTRACT 3 1.前言 4 1.1黄酮类化合物的基本信息 5 1.2山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷简介 5 1.2.1山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷结构 6 1.2.2山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷基本结构解析和官能团鉴定 6 1.2.3山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷性状 6 1.3蛋白质的结构的基本信息 7 1.3.1蛋白质的一级结构(primary structure) 7 1.3.2蛋白质的二级结构(secondary structure) 7 1.3.2.1 α-螺旋结构(Alpha helix) 7 1.3.2.2 β-折叠结构(Beta sheet) 8 1.3.2.3 β-转角结构(Beta turn) 8 1.3.2.4 无规则卷曲结构(random coil) 8 1.3.3 蛋白质的三级结构(tertiary structure) 9 1.3.4 蛋白质的四级结构 9 1.4人血清白蛋白分子(HSA)简介 9 1.4.1人血清白蛋白分子的基本结构 9 1.4.2人血清白蛋白分子的功能 10 1.4.3人血清白蛋白分子与药物结合位点 11 1.5分子对接简介 11 1.6 Sybyl软件简介 12 1.6.1 Sybyl/base模块 12 1.6.2 FlexX模块 12 1.6.3 Csore模块 12 2.实验部分 13 2.1蛋白质结构的处理 13 2.2配体小分子的处理 15 2.3山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子与1H9Z初步分子对接 15 2.3.1山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子在HSA(1H9Z)中结合位点的分析 17 2.3.2山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子与HSA结合位点氨基酸氢键相互作用力的分析 18 2.3.3对接结果采用Csore模块进行打分结果 19 2.4山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子与1N5U初步分子对接 20 2.4.1山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子在HSA(1N5U)结合位点的分析 21 2.4.2山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子与HSA结合位点氨基酸氢键相互作用力的分析 22 2.4.3对接结果采用Csore模块进行打分结果 23 2.5通过与不同复合物结构对接前后山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子构象 23 3.结果与讨论 25 4.展望 27 参考文献 27 山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷与人血清白蛋白分子相互作用的研究 摘 要采用计算机虚拟筛选的方法,从人血清白蛋白分子复合物结构(1H9Z)(1N5U)出发,利用SYBYL-X 1.2软件进行分子对接研究,通过基于受体的药物设计的方法进行分子对接,Csore模块进行数据分析并且分析山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子与人血清白蛋白分子对接的位置及相互作用,证实山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子能被人血清白蛋白分子储存和运输。本文的研究为药物的快速设计及避免许多繁重的试验过程提供了精确的理论依据,为进一步进行药物小分子的官能团的修饰和结构提供部分参考。 关键词人血清白蛋白分子 山奈酚-7-O-α-L-鼠李糖苷分子 分子对接 AAdopt the method of computer virtual screening, from human serum albumin (1 h9z) molecular composite structures (1 n5u), using SYBYL molecular docking studies - X 1.2 software, through the drug design method based on receptor molecular docking, Csore module for data analysis and analyze resurrectionlily phenol - 7 - O - alpha - L - buckthorn indican molecular docking with human serum albumin molecules of position and interaction of confirmed resurrectionlily phenol - 7 - O - alpha - L - buckthorn indican can be human serum albumin molecules storage

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