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系统发育树构建PPT构建步骤
没有一种方法能够保证一棵系统发育树一定代表了真实进化途径。然而,有些方法可以检测系统发育树检测的可靠性。 第一,如果用不同方法构建树能得到同样的结果,这可以很好的证明该树是可信的 第二,数据可以被重新取样,来检测他们统计上的重要性。 谢谢! * 多序列比对及 系统发生树的构建 —— 邹长江 主要目的: 了解分子进化及系统发育分析 掌握多序列比对方法 熟悉系统发育树建立方法 掌握用Mega软件进行构建系统发育树 系统发生(phylogeny)——是指生物形成或进化的历史 系统发生学(phylogenetics)——研究物种之间的进化关系 系统发育树(phylogenetic tree)——描述物种之间进化关系 系统发育树(phylogenetic tree)——又称evolutionary tree进化树)就是描述这一群有机体发生或进化顺序的拓扑结构。它可以用来研究不同物种间的进化关系,这一直是生物学的研究热点。 拓扑(Topology)将讨论范围内的事物之间的相互关系表示出来,将这些事物之间的关系通过图表示出来。 两个临近的分支的连接处称为节点(node),表示推断祖先的现存类群在树最底部的分支点成为根节(root node), 一个单一的共同的祖先被定义为进化支(clade)或者单源群(monophyletic group) 树的分支模式被成为拓扑结构(tree topology) 系统发育树建立方法 NCBI——BLAST——输入序列对比——记录好以下几方面: 名 称: Uncultured bacterium clone YU201H10 序列号: FJ694683 /FJ694514 文 献: TITLE Circumpolar synchrony in big river bacterioplankton 序列长度:353 相 似 比: 99% 核酸序列 分类地位 Mega下载地址/ *
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