NAP1基因和ARHP基因启动子区的生物信息学分析.pdfVIP

第19卷第3期 湖南文理学院学报(自然科学版) Vbl．19NO．3 of 2∞7年9月 Jour她lHu聃n ofArtsand Science UIliVe姻ity Science(№tIlralEdition) Sep．2∞7 文章编号：1672—6146(2007)03．0037—04 NAPl基因和ARHP基因启动子区的生物信息学分析 邱明轩1，李峰1…，张建宏1，张建平1，覃佐东1，徐燕慧1 摘要：采用进化足迹法，利用生物信息学在线软件，分析 源．生物信息学分析表明，该蛋白可能为一参与转 了鼻咽癌相关肽基因NAPl和成人视网膜假定蛋白基因录调控的核蛋白【4J． ARHP的启动子结构，在人和小鼠NAPl基因的启动子保守 本文利用生物信息学技术并结合进化足迹法 区内预测出38个共同的转录因子结合部位，在人和小鼠 对人NAPl基因和ARHP基因的启动子区进行了分 ARHP基因的启动子保守区内预测出44个共同的转录因子析，获得了多个基因启动子区的转录因子结合位点， 结合部位，分析结果为NAPl基因和ARHP基因调控区的分 为NAPl基因和AImP基因调控区的分析与鉴定， 析与鉴定，基因表达调控机制的研究提供了重要的参考． 基因表达调控研究奠定了基础． 美键词：NAPl；进化足迹法；启动子区；转录因子结合部 1材料与方法． 位：生物信息学分析 中图分类号：Q786 文献识卿码：A 1．1材料 1．1．1 NAPl基因序列和基因组结构 基因表达调控机制是后基因组时代一个重要 该基因cDNA序列全长为573 bp，命名为鼻咽 的研究内容．基因正确的表达依赖于一个复杂的调 癌相关肽科PC—associ砷ed 控机制。不同的转录因予对外界环境的各种刺激或 700 不同发育阶段的各种信号做出反应，结合于转录调 间，编码由．85个氨基酸组成，分子量为9 控元件，激活或抑制基因的转录，从而控制不同基 因的表达．启动子是一个十分有层次的结构，单个 因组跨越9179bp，含5个外显子和4个内含子．内 的转录因子结合位点可以构成最简单的启动子，它 含子和外显子交界区符合ag．gt规则．该基因定位 们一般是一段短序列DNA(10～20bp)…．转录因子 于4q13． 1．1．2 factor，TF)也称反式作用因子(trans—ARHP基因序列和基因组结构 (transcription 672 actingfactor)，是一类细胞核内蛋白质因子，通过与 该基因cDNA序列全长为1bp，命名为成 retina 顺式作用元件和RNA聚合酶的相互作用来调节转 人视网膜假定蛋白基因(adult 录的活性．进化足迹法指通过两种或两种以上基因 组间同源基因序列的比较，1发现进化中保守的功能 读框架位于第304．15位之间，编码417个氨基酸， 元件．进化中的突变对于序列功能是很好的指示． 预测分子量为46580 如果一段序列高度保守，则很可能意味着这段序列