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2015-09-27 发布于重庆
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Representation of Roles in Biomedical Ontologies a Case Study in Functional Genomics.pdf

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Representation of Roles in Biomedical Ontologies a Case Study in Functional Genomics

Representation of Roles in Biomedical Ontologies: a Case Study in Functional Genomics 1 2 1 Anita Burgun , M.D., Ph.D., Olivier Bodenreider , M.D., Ph.D., Franck Le Duff , M.D., 3 3 Fouzia Moussouni , Ph.D., Olivier Loréal , M.D., Ph.D. 1Laboratoire d’Informatique Médicale, Faculté de Médecine, 35033 Rennes, France 2U.S. National Library of Medicine, Bethesda, Maryland 3INSERM U522, C.H.R.U Pontchaillou, 35033 Rennes, France Anita.Burgun@univ-rennes1.fr ABSTRACT Representin g roles has been a central issue in conceptual modeling, e.g. [3]. While taxonomies of Objective: Representing roles, i.e. functions of concepts (is-a hierarchies) organize things according proteins, sequences and structures, is the cornerstone to their essential features (what x is), and meronomies of knowledge representation in functional genomics. (part -of hierarchies) represent their constitutive The objective of this study is to investigate features (what x is made of), two major