结核分枝杆菌与牛分枝杆菌全基因组比较分析.pdfVIP

畜牧兽医学报 ， （）： ２０１０４１９ １１２６１１３２ 　 犃犮狋犪犞犲狋犲狉犻狀犪狉犻犪犲狋犣狅狅狋犲犮犺狀犻犮犪犛犻狀犻犮犪 结核分枝杆菌与牛分枝杆菌全基因组比较分析 朱汝仪，潘 文，赵明秋，琚春梅，易 琳，王佳莹，胡永明，陈金顶 　 　 （华南农业大学 兽医学院，广州 ５１０６４２） 摘 要：本研究旨在揭示结核分枝杆菌与牛分枝杆菌全基因组的遗传差异，为结核分枝杆菌与牛分枝杆菌的鉴别 　 诊断提供新的分子标志。利用结核分枝杆菌 和牛分枝杆菌 ／ 的全基因组测序结果，通过在线比 Ｈ３７Ｒｖ ＡＦ２１２２９７ 对，完成了两者的全基因组比对分析。结果显示 ／ 相对 存在 处大片段缺失，大小范围为 ＡＦ２１２２９７ Ｈ３７Ｒｖ １４ ０．８～ ，其中 、 及 等 处缺失为首次报道。此外， ／ 还存在 处基因内部小片段的缺 １２．７ｋｂ ＲＤ１８ＲＤ１９ ＲＤ２０ ３ ＡＦ２１２２９７ ６ 失，大小范围为 ，其中 及 基因内部缺失为首次报道。 相对 ／ 存在 １２ ７１４ｂ Ｍｂ１３１９ Ｍｂ３２９３ｃ Ｈ３７Ｒｖ ＡＦ２１２２９７ ６ ～ ｐ 处大片段缺失，大小范围为 。此外， 还存在 处基因内部小片段的缺失，大小范围为 １．３ ５．４ｋｂ Ｈ３７Ｒｖ ５ １０ ４８ ～ ～ ，这些基因的内部缺失都为首次报道。通过结核分枝杆菌 和牛分枝杆菌 ／ 的全基因组序列比 ｂｐ Ｈ３７Ｒｖ ＡＦ２１２２９７ 对，揭示了这 种菌株间的遗传差异，阐述影响表型特征、寄主偏好性及毒力差异的关键性遗传基础。这些新的认 ２ 识将有助于开发新的药物、诊断试剂和疫苗。 关键词：结核分枝杆菌；牛分枝杆菌；全基因组比较 中图分类号： 文献标识码： 文章编号： （ ） Ｓ８５２．６１８ Ａ ０３６６６９６４２０１００９１１２６０７ 　　　　 　　　　 犜犺犲犆狅犿 犪狉犪狋犻狏犲犃狀犪犾狊犻狊狅犳狋犺犲犠犺狅犾犲犲狀狅犿犲犛犲狌犲狀犮犲狊狅犳 狆 狔 犵 狇 犕 犮狅犫犪犮狋犲狉犻狌犿狋狌犫犲狉犮狌犾狅狊犻狊犪狀犱犕 犮狅犫犪犮狋犲狉犻狌犿犫狅狏犻狊 狔 狔 ， ， ， ， ， ， ＺＨＵＲｕｉＰＡＮＷｅｎ ＺＨＡＯＭｉｎｉｕ ＪＵＣｈｕｎｍｅｉＹＩＬｉｎ ＷＡＮＧＪｉａｉｎ ｙ ｇｑ ｙｇ