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动物RNA病毒全长感染性克隆的研究进展
曾秀王孝友 范守成
(重庆市畜牧科学研究院 重庆 荣昌402460)
RNA病毒的感染性克隆(infectiousclones)是指在细菌质粒中含有整个病毒基因组的cDNA拷
贝,使得cDNA本身或从cDNA体外转录所得的RNA转染培养细胞或宿主后具有感染性。这一过程
的实现称为病毒的拯救(rescue)。(1)全长基因组感染性克隆构建技术也叫反向遗传学技术。经典遗传
学通过分析生物性状、表型和遗传物质研究生命的发生与发展规律;反向遗传学则是在获得生物体基
因组全部序列的基础上,再按组成顺序构建含生物体必需的基因元件的基因组,让其装配出具有生命
活动的个体,最后对靶基因进行定点突变、基因插入或缺失、基因置换等必要的改造,构建为修饰基
因组,研究生物体基因组的功能,以及这些修饰对生物体的表型、性状等产生的影响等。
1 研究动物RNA病毒感染性cDNA克隆的意义
(IBV)等,可引起人或动物产生严重的传染病。这些传染病的流行和暴发,给畜牧业和人类健康造
成了巨大损失和严重影响,为此,目前对动物RNA病毒分子生物学特性方面的研究已成为大家共同
关注的焦点。
由于RNA本身的结构特点和不稳定性,相对于DNA病毒来说,更增加了其分子结构及功能研
究的难度。随着反向遗传学的发展,在RT--PCR和体外转录RNA技术基础上建立起来的全长感染
病毒基因组RNA难以操作的难题,可以通过对其cDNA这一稳定基因产物的人为操作,进一步在分
子水平上研究RNA病毒。该技术已成为研究动物RNA病毒的重要方法。
2动物RNA病毒感染性cDNA克隆的内容
构建RNA病毒感染性cDNA克隆的基本内容包括:①获得动物病毒基因组全长cDNA:通过
RT—PcR分段克隆病毒基因组,选择具有重叠部分且覆盖整个基因组序列的数种重组子拼接成全长
cDNA。②对该cDNA进行一定的基因人工操作:可对稳定的cDNA进行定点突变、基因插入或缺
失、基因置换等必要的改造。③利用体外转录等方法将其转变为RNA,用改造后的病毒RNA转染
适宜的宿主细胞,以进行病毒分子生物学研究:选择合适的反向遗传系统拯救出活病毒,可直接转染
培养细胞或宿主,鉴定其感染性。
3动物RNA病毒感染性cDNA克隆的研究进展
·172·
二、专业论述
噬菌体T7
RNA聚合酶、T7启动子和DNA片段,克隆出具有自我转录功能的DNA模板,并于体外转
录出具有一定长度的小RNA序列。尽管当时只能得到12~35个核苷酸的小片段RNA,但证明了合
V)全长基因组转录产物,并且证明转录产物和用于合成eDNA的RNA一样,具有仙台病毒的株系特
异表型。仙台病毒全长感染性eDNA的构建和应用,标志着动物RNA病毒全长感染性eDNA的首次
研究成功。
和双链、甚至分节段的RNA病毒都相继获得基因组全长感染性cDNA克隆。其中动物病毒中黄病毒
科和小RNA病毒科占了很大一部分。
础,构建了其分子克隆。这些eDNA片段是除了5’末端核苷酸以外的VEEV基因组序列。利用体
外突变技术,将T7启动子、单一G残基和精确的5’末端克隆到5’端大部分片段上游,再和eDNA
扩增中分离的特有限制性片段连在一起,构建出了待用的全长VEEVeDNA克隆。体外合成的RNA
缺少了102个核苷酸,这种缺失体在子代病毒中依然存在,但并不影响它们在CEF和BHK细胞或者
Vero细胞中的生长。
同年,Duechler等利用人鼻病毒2型血清型RNA、T7
RNA聚合酶启动子和覆盖全长基因组的
eDNA拷贝构建了全长eDNA克隆。合成的RNA5’末端包含了2个额外的G残基,转染Hela细胞
形成蚀斑;相反,当合成的RNA在5’端含有16个额外核苷酸时却没有感染性。
菌体SP6启动子后,体外合成的RNA转染BHK一21细胞可产生感染性病毒颗粒,这些病毒颗粒对
原代牛肾细胞及小鼠具有高的感染性。含足够长poly(C)片段的病毒复制子首先在酵母细胞中建
立,这些构建体中的一部分能保留在大肠埃希氏菌中用来产生感染性RNA。cDNA重组质粒中的po—
yer等在此基础上对poly(C)的作用又进行了大量的研究。
(JEV)的全长cDNA。为了验
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