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第七届全国x射线衍射学术会议论文集 1998年11月武汉
4.苯甲酰基.3.(邻氯苯基).1.乙酸乙酯基.1a.苯基一1,la,2,3.
四氢化-4H一环丙胺-【l,2一alll,sl一苯并二氮杂
晶体结构及构象研究
孙命张欣t王瑾玲缪方明
(天津师范大学晶体所天津300074)
(*天津教育学院化学系天津300020)
金声 谅炯
(北京大学化学与分子工程学院北京 100871)
1,5-苯并二氮杂是一类具有生理活性的物质【1’2”,但它们的立体结构研究,尤其是它
们的构象分析甚少报导。现代药物分子设计理论【3J认为药物分子(底物)的活性取决于与
生物大分子(受体)活性中心作用时相匹配的活性构象。因此在探讨三维药物定量构效关
系(QSAR)的研究中,模板分子的分子结构及活性构象的选择至关重要。随着计算化学
的发展,分子设计软件的功能日益强大,构象分析方法越来越丰富。分子动力学(MD)
是非常有效的方法,其中的动力学模拟退火(Simulated
Annealing)为寻找最低能量构象
提供了新途径。北京大学金声等合成了一系列l,5.苯并二氮杂衍生物【“,本文用x.射线
衍射方法测定了标题化合物的分子结构。
使用Ertraf-Nonius
CAD4衍射仪,采用单色化的MoKot射线,在l≤e盟4。范围内,
室温下收集独立衍射点4507个,其中I.≥3cs(D的可观察衍射点1562个用于结构解析和修正。
C32H37C11N203,也£;523 9065、c=
04,单斜晶系,空间群P21/n,a=1,4403(4),b=0
21220(5)nm,p=92.86(2)。,D
16940m~,最终偏离因子基=0.076和出=O.075。
分子的核心骨架为I,5-苯并二氮杂,形成一类船式构象,N(1)、N(2)、cO)、
0
构象完全不同。
天津市教委资助项目 +联系人
图1分子结构透视图
与七元环并接的三元环环内三个夹角分别为643(6)、57.3(6)和58.4(5)。,三元环的严
重扭曲与C(3)原子上连着苯基和C(4)原子上连着乙酸乙酯基的空间位阻有关a分子中存在
着四个芳香环,它们的平面夹角在46.O(2)。97O(3)。范围内,形成类似螺旋桨的结构,芳环
堆积效应并不明显。
在Silicon
分子优化构象进行分子动力学模拟退火研究。结果表明,标题化合物中七元环具有三种稳
定的构象:船式、椅式和类船式。其中以船式构象为最稳定,并存在着明显的芳环堆积作
用。分子中七元环同时并接苯环和三元环,且环中的N2·C12-CIl_Nl有Ⅱ键成分,大大限
制了七元环构象的相互转换。
参考文献:
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l-LKohnke—Heterocvclic
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