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最大熵法分析寡聚核苷酸链内碰撞的荧光相关光谱.pdf
物理化学学报(Wuli Huaxue Xuebao)
April A cta Phys. Chim. Sin., 2010, 26(4) ：1087-1092 1087
[Article]
最大熵法分析寡聚核苷酸链内碰撞的荧光相关光谱
延东 周晓雪 赵新生*
( 京大学化学与分子工程学院化学生物学系, 分子动态与稳态结构国家重点实验室,
京分子科学国家实验室, 北京 100871)
摘要： 准确地由荧光相关光谱(FCS)的实验数据提取动力学信息一直是一个挑战. 本文对比了三种主要的方
法: 依赖于模型的多指数函数法, 经验的拓展指数函数法和不依赖于模型的最大熵法. 多指数函数法的物理意义
直接但在复杂体系中难以应用和解释. 拓展指数函数法简单易 但其物理意义含混不清. 最大熵法不依赖于具
体的物理模型但拟合结果对实验噪音很敏感. 经研究我们发现一个好的选择是将最大熵法和多指数函数法结合
在一起使用. 对寡聚核苷酸链内碰撞荧光相关光谱的研究发现, 在单链DNA 中可以形成碱基对时, 有两个并
的链内碰撞反应. 以前的拓展指数函数法分析则不能提供这样的信息. 我们建议在荧光相关光谱研究中审慎地
使用最大熵法.
关键词： 荧光相关光谱; 弛豫时间分布; 拓展指数函数; 最大熵法; 寡聚核苷酸; 光致电子转移
中图分类号： O643
Maximum Entropy Method for Analyses of Fluorescence Correlation
Spectra of Oligonucleotide Intra Chain Collision
YIN Yan Dong ZHOU Xiao Xue ZHAO Xin Sheng*
(Beijing National Laboratory f or Molecular Sciences, State Key Laboratory f or Structural Chemistry of Unstable and
Stable Species, Department of Chemical Biology, College of Chemistry and Molecular Engineering,
Peking University, Beiji ng 1008 71, P. R. China)
Abstract ： It has been a challenge to accurately extract dynamic information from experimental fluorescence
correlation spectroscopy (FCS) data. In this paper, we compare three maj or fitting methods: the model dependent multiple
exponential function (MultiExp), the empirical stretched exponential function (StreExp), and the exponential function
based on the model free m
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