PCR_DGGE技术在农田土壤微生物多样性的研究中应用.pdfVIP

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第 23 卷第 8 期 生  态  学  报 V o l. 23,N o. 8 2003 年 8 月 A CTA ECOLO G ICA S IN ICA A ug. , 2003 - 技术在农田土壤微生物多样性研 PCR D GGE 究中的应用 罗海峰, 齐鸿雁, 薛 凯, 张洪勋 ( 中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室, 北京 100085) 摘要: 变性梯度凝胶电泳技术(D GGE) 在微生物生态学领域有着广泛的应用。研究采用化学裂解法直接提 取出不同农田土壤微生物基因组DNA , 并以此基因组DNA 为模板, 选择特异性引物 F 357 GC 和R 518 对 16S 基因的 3 区进行扩增, 长约 230 的 产物经变性梯度凝胶电泳( ) 进行分离后, 得到不 rRNA V bp PCR D GGE 同数目且分离效果较好的电泳条带。结果说明, D GGE 能够对土壤样品中的不同微生物的 16S rRNA 基因 的 3 区的 扩增片断进行分离, 为这些 片断的定性和鉴定提供了条件。与传统的平板培养方法 V DNA DNA 相比, 变性梯度凝胶电泳(D GGE ) 技术能够更精确的反映出土壤微生物多样性, 它是一种有效的微生物多 样性研究技术。 关键词: 变性梯度凝胶电泳( ) ; 基因组 ; 16 ; 微生物多样性 D GGE DNA S rRNA - A prelim inary applica tion of PCR D GGE to study m icrobia l d iversity in so il , , ,   (E nv ironm ental B iotechnology LUO H ai Feng Q I Hong Yan XU E Kai ZHAN G Hong Xun . , , , 100085, ). L ab R esearch Center f or E co env ironm ental S ciences Ch inese A cad emy of S ciences B eij ing Ch ina A cta Ecolog ica S in ica , 2003, 23 (8) : 1570~ 1575. Abstract: Few traditional m ethods are app licable in study of

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