47例汉族HIV／AIDS患者外周血白细胞线粒体DNA高变1区序列分析.pdfVIP

· 446· 主 塞堕塑 童 苤查 塑生 旦箜垫鲞笙 塑 ! xpcinViml，Decembe2009，Vo1．23，No．6 ． 论 著 47例汉族 HIV／AIDS患者外周血 白细胞线粒体 DNA高变 1区序列分析 昊亚松 ，陈德喜 ，陈新月，石英，柳雅立，张洪海，吴昊 【摘要】 目的 分析中国汉族HIV．1感染者外周血 白细胞线粒体 DNA的非编码区的高变 1区 (HR1)突变情况 ，探讨 HIV对线粒体影响。方法 分离47例未接受过抗反转录病毒治疗 、无机会性 感染的HIV／AIDS患者 的外周血细胞 ，提取外周血 白细胞 DNA，PCR扩增 DNA非编码 区HR1的大约 600bp的DNA片段 ，产物纯化后进行测序 ，测序结果和剑桥序列 比对 ，分析突变位点以及各位点的突 变频率 。结果 HIV／AIDS患者在非编码 HR1区(核苷酸位点16024～16383之间)有 124个位点存在 多态性 ，碱基变化率为0～20．47％(中位数为5．33％)。大多数突变方式是 c—T或 T—C的变化 。在 第 16223核苷酸位点，共 出现 了36个 C—T改变 ，发生率为 70．97％(36／47)；在第 16362核苷酸位点， 共出现 了26个 T—c变化 ，发生率为55．32％(26／47)，3个 T—c改变 ，发生率为 6．38％(34／7)；与 以往 报道数据类似。结论 HIV．1可能导致线粒体非编码 区突变增加 。 【主题词】 HIV； 线粒体； DNA； 突变 SequencepolymorphismsofmitochondrialDNA hypervariable 1ofperipheralblood cellsfrom 47 m V， A patients ofHannationaHty WU Ya-song’，CHEN De-xi．CHEN Xin-yue，sHlYing，nU Ya-li， zHANGHong-hai，WUHao．’DivisionofTreatment andCare．NⅡtionalCenterforAIDs|sTD Controtnnd Prevention，ChinaCDC；Be ng 100050，China Correspondingauthor：WUHao．E-maif：wuhd2002@yaboo．corn ．cn 【Abstract】 0bjective Toinvestigatealterationsofhypervariableregion1(HR1)ofmitochondrialDNA (mtDNA)inwhitebloodcelsofChineseHallnationalityHIV，AIDSpatients．Methods Blood ceHswere obtainedfrom 47casesoftherapy—naYveHIV／AIDSpatientswithoutopportunity infeetion andDNA wereextracted usingblood DNA extractedkit．About600bpfragmentswhich contain HR lwereamplifiedbyPCR．Alterations weredeterminedby directedDNA sequencing．Results Therewere l24 polymorphism sitesinmtDNA HR l (nbl6024．16383)in47HIV／AIDSpatients．l’}lealterationratewas0to2O．47％ (median5．33％)．36cases experiencedC to T QUCleotide change atnt16223。and the alteration rate Was70．97％ ．Atnt16362．26 individualsshowedT to C nucleotide changeand3 individualsshowedT toG alteration．alterationratewas 55．32％(26／47)and6．38％(3／47)individually．Conclusion HIVinfectionmayc