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并行计算简介 高性能事业部:曹振南 caozn@ czn@ 2004.4 讲座主要内容提示 并行计算简介 编译环境 数学库 并行计算机体系结构 并行软件环境 并行计算机性能评测 MPI 、PVM、OpenMP 并行计算--高性能计算 并行计算(Parallel Computing) 高端计算(High-end Parallel Computing) 高性能计算(High Performance Computing) 超级计算(Super Computing) 任何高性能计算和超级计算都离不开使用并行技术 计算科学与传统的两种科学,即理论科学和实验科学,并立被认为是人类认识自然的三大支柱,他们彼此相辅相成地推动科学发展与社会进步。在许多情况下,或者是理论模型复杂甚至理论尚未建立,或者实验费用昂贵甚至无法进行时,计算就成了求解问题的唯一或主要的手段。 并行:古老的思想! “...并行计算并不是什么新的思想,只是将它扩展应用于计算机而已”. 作者也不认为这种扩展应用会存在什么无法克服的困难. 但也不要期待有效的并行编程方法与技术能够在一夜之间诞生. 期间还需要有许多的工作和实验要做. 毕竟, 今天的编程技术(串行)是若干年来艰苦的探索才取得的. 现在编程工作似乎成了一种令人单调乏味的工作,事实上,并行编程的出现将会使重新恢复编程工作者们的探索精神 ...” (Gill, S. (1958), “Parallel Programming” The Computer Journal, vol. 1, April, pp. 2-10.) 什么是并行计算? 并行计算: 由运行在多个部件上的小任务合作来求解一个规模很大的计算问题的一种方法 例: 在曙光2000上用8个节点计算的Mandelbrot集结果(Mandelbrot为分形理论创始人) 现代计算机的共同特点: 并行性 现代计算机的共同特点: 并行性 为什么要做并行计算? --应用需求 为什么要做并行计算? 人类对计算及性能的要求是无止境的 从系统的角度:集成系统资源,以满足不断增长的对性能和功能的要求 从应用的角度:适当分解应用,以实现更大规模或更细致的计算 为什么要做并行计算? 问题: 科学和工程问题的数值模拟与仿真 计算密集 数据密集 网络密集 三种混合 要求:在合理的时限内完成计算任务 秒级 制造业 分钟级 短时天气预报(当天) 小时级 中期天气预报(3~10日) 尽可能快 长期天气预报(气候) 可计算 湍流模拟 并行计算的功能 降低单个问题求解的时间 增加问题求解规模、提高问题求解精度 (多机同时执行多个串行程序)容错、更高的可用性、提高吞吐率 如何实现并行计算? 分而治之 并行化的主要方法:分而治之 根据问题的求解过程,把任务分成若干子任务(任务级并行或功能并行) 根据处理数据的方式,形成多个相对独立的数据区,由不同的处理器分别处理(数据并行) 讲座主要内容提示 并行计算简介 编译环境 常用编译器 编译优化 如何编译 数学库 并行计算机体系结构 并行软件环境 并行计算机性能评测 MPI 、PVM、OpenMP GNU Compiler GNU Compiler 自由软件,一般操作系统都自带 支持C/C++、Fortran77、Java、COBAL等等许多语言 支持大部分硬件平台 高性能计算中常用的: C/C++:GCC (GNU C/C++ Compiler) Fortran 77:G77 不支持Fortran 90/ 95 不支持OpenMP 是最常用的编译器,性能一般(相对于一些针对特定平台优化的编译器) 由于缺少对Fortran 90/ 95,限制了其在高性能计算中的使用 PGI Compiler PGI Compiler 由Portland公司开发的编译器 支持AMD Opteron/Althon处理器、Intel Xeon处理器等,在Opteron上同时支持32-bit和64-bit() 支持Linux、Windows 支持C/C++(pgcc)、Fortran77(pgf77)、Fortran90/95(pgf90)、HPF(High Performance Fortran) 支持多线程和OpenMP 必威体育精装版版本:5.1 需要购买,但可以从网上得到15天试用版本 Intel Compiler Intel Compiler 由Intel公司针对Intel处理器开发(Xeon、Pentium) 支持Linux、Windows 支持C/C++(icc:Intel C/C++ Compile

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