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 微小 RNA 微阵列芯片在肿瘤研究中的应用# 禚洪庆，张辉，王杉** （北京大学人民医院胃肠外科，北京 100044） 5 10 15 20 25 摘要：微小 RNA(miRNA)是近年来新发现的一类长度约为 22 nt 的、单链内源性高度保守的 非编码小分子 RNA,参与细胞增殖、分化、凋亡等多种重要细胞活动，与肿瘤发生发展、侵 袭转移有密切关系，目前已成为肿瘤研究领域的热点。自 Liu 等首先成功使用微阵列芯片检 测多种组织和细胞 miRNA 表达后，miRNA 微阵列芯片逐渐被应用于各种肿瘤研究中，并 呈现出巨大的应用价值。 关键词：miRNA； 肿瘤；微阵列芯片 中图分类号：R735.5 microchip for genome-wide microRNA profiling in human cancer ZHUO Hongqing, ZHANG Hui, WANG Shan (peking university peoples hospital dapartment of GI surgery, Beijing 100044) Abstract: MicroRNAs (miRNAs) are a class of small noncoding RNA genes recently found to be abnormally expressed in several types of cancer. The miRNA microchip is a robust tool, not only for detection of the pattern of miRNA expression, but also for expression quantification. The use of the array has several advantages for miRNA expression detection. Keywords: miRNA; Tumor; Chip 微小 RNA(miRNA)是近年来新发现的一类长度约为 22 nt 的、单链内源性高度保守的非 编码小分子 RNA[1],参与细胞增殖、分化、凋亡等多种重要细胞活动[2]，与肿瘤发生发展、 侵袭转移有密切关系[3]，目前已成为肿瘤研究领域的热点。自 Liu 等[4]首先成功使用微阵 列芯片检测多种组织和细胞 miRNA 表达后，miRNA 微阵列芯片逐渐被应用于各种肿瘤研 究中，并呈现出巨大的应用价值。 1  miRNA 微阵列芯片检测原理 miRNA 微阵列芯片的原理是将待测样品 miRNA3’端标记上荧光集团，在玻璃片等支 30 持物上固定高密度已知序列 DNA 探针，miRNA 与微阵列芯片上互补的特定探针杂交，然 后检测杂交信号强度及数据处理，获得 miRNA 表达谱，从而全面比较不同器官或组织、正 常和病变组织中 miRNA 微列阵芯片是目前研究大量样本中千余种 miRNA 肿瘤特异性表达 常用的高通量方法。 2  miRNA 微列阵芯片检测的标本类型 35  2.1  肿瘤组织标本 由于 miRNA 片段小不易发生降解，微列阵芯片不但能检测新鲜冰冻组织 miRNA 表达 [6]，也能检测 RNA 已经发生降解的组织样品。Guo 等[7]使用微列阵芯片检测了食管癌及癌 旁正常组织，其中 31 对冰冻组织 RNA 已降解，24 对新鲜标本 RNA 未降解，两组的 miRNA 表达信号几乎相同，提示 miRNA 微列阵芯片可以检测 RNA 已经发生降解的组织样品。Zhang 基金项目：高等学校博士学科点专项科研基金(20090001110089) 作者简介：禚洪庆，男，博士，消化道肿瘤发生发展分子机制。 通信联系人：王杉，男，主任医师，消化道肿瘤发生发展分子机制。E-mail: pkuwanshang@ -1-  40 45 50  等[8]使用同一微列阵芯片，检测配对的新鲜标本和福尔马林固定石蜡包埋的淋巴结，一致 性高达 0.847~0.948，提示可以应用 miRNA 微列阵芯片检测肿瘤石蜡组织标本，且结果可靠。 2.2 肿瘤细胞标本 miRNA 微阵列芯片也常用于检测各种肿瘤细胞株 miRNA 表达。Tavazoie 等【9】使用 微列阵芯片检测了乳腺瘤 MDA-MB-231 细胞及容易转移到骨和肺的亚细胞株 miRNA 表达， 发现转移亚细胞中 8 种 miRNA 低表达。另外有研究检测了 16 种肺癌细胞株，发现 miRNA 表达谱能够分开 9 种小细胞肺癌细胞株和 7 种非小细胞肺癌细胞株。 2.3 肿瘤患者血液标本 一般认为微阵列芯片能检测血液 miRNA 表达。Lodes