简明gephi指导教程.pdf

gephi 简要教程 邱喆 2012-11-6 《网络科学导论》 Gephi 是一款开源免费跨平台基于JVM 的复杂网络分析软件, 其主要用于各种网络和复 杂系统。Gephi 软件可以从官方网站/免费获得。gephi 软件使用前需 要安装Java Runtime Environment （简称JRE，可以从天空软件园 /soft/27213.html 下载获得）。 用Gephi 处理网络的主要步骤： 1. 收集现有网络，得到用边两边节点表示的CSV 文件。如果得到excel 文件，可以用另存 为获得csv 文件。 得到例如： 1,2 2,3 3,4 4,5 5,6 1,6 1,3 2. 运行gephi 软件。如图。 选择File-Open。将File Type 改为CSV，选择对应的csv 文件，点击Open 打开。 3. 出现如图的导入对话框。可以修改Directed/Undirected 等。确认无误点击Ok。 4. 导入后出现如图界面。中间是图的一个可视化表示。 5. 右手边的Statistics 栏目中可以计算度分部、模块度、社团划分、PageRank 等。 6. 如果需要分析随机图，在第二步时点击File-Generate-Random Network。即可生成ER 随 机图。 7. 以此图为例，先到Statistics 栏计算Average Degree 和Modular。点击run 后获得结果。 8. 回到左手边的Partition 窗口。点击Nodes 下面的刷新按钮，再从下拉菜单选择 Modularity class。后选择Apply。即可根据社团结构染色。 9. 在左手边的Ranking 窗口，选择第一栏第四个图标，下面标准选择Degree。点击Apply 即可按照度大小改变节点大小可视化。 10. 左下角的Layout可以调整可视化图的布局。Choose a layout 的下拉栏选择ForceAtlas， 在下面的Adjust by size 右边勾选. 点击Run 即可开始。得到合适的布局时点击Stop。 11. 完成后选择file-export-PNG file 即可输出图形文件。 如有更多问题请发送email 到phoeagon_AT_